Кишечные инфекции

Острые кишечные инфекции (ОКИ) являются одной из ведущих причин госпитализации в инфекционные стационары. Из-за несовершенства лабораторной диагностики около 65% заболеваний этой группы, согласно официальной статистике РФ, составляют ОКИ неуточненной этиологии. Применение тестов на основе ПЦР позволяет значительно улучшить этиологическую расшифровку ОКИ, повысить эффективность расследования вспышек и вести мониторинг окружающей среды на наличие возбудителей ОКИ. 

Наборы реагентов

Экстракция ДНК/РНК

Наибольшее практическое использование находит выявление возбудителей кишечных инфекций в фекалиях (для этиологической диагностики ОКИ вирусной и бактериальной природы) и концентратах образцов воды (для мониторинга контаминации вод вирусами, вызывающими ОКИ).

Универсальным набором реагентов для выделения нуклеиновых кислот из этих материалов является набор реагентов «РИБО-преп».

Амплификация и детекция

В соответствии с современными литературными данными, наиболее часто выявляемыми и повсеместно распространенными этиологическими агентами ОКИ являются:

1. Бактериальные агенты:

• микроорганизмы рода Shigella и энтероинвазивные E.coli (EIEC); микроорганизмы рода Salmonella; термофильная группа микроорганизмов рода Campylobacter. См. каталог


• возбудители эшерихиoзов: энтеропатогенные E.coli (EPEC) и энтероаггрегативные E.coli (EAEC). См. каталог

2. Вирусные агенты:

• ротавирусы группы А; норовирусы 2 генотипа; астровирусы 


• аденовирусы группы F (40 и 41 типы)

Менее широкую распространенность, но не менее высокую значимость при возникновении эпидемических вспышек, имеют следующие возбудители:

• Vibrio cholerae 


• возбудители тифо-паратифозных заболеваний 


• возбудители иерсиниоза и псевдотуберкулеза


• энтеротоксигенные E. coli (ETEC), энтерогеморрагические E. coli (EHEC)


• энтеровирусы и другие инфекционные агенты

Соотношение частоты выявления вирусных и бактериальных патогенов варьирует в разных возрастных группах: у детей до 3-х лет на долю вирусных агентов приходится 80-90% заболеваний, на долю бактериальных – 10-20%; среди взрослых пациентов доля вирусных возбудителей снижается до 30%.

Тест выбора для этиологической диагностики ОКИ - набор реагентов «АмплиСенс® ОКИ-скрин-FL», позволяющий выявлять наиболее распространенные этиологические агенты острых кишечных инфекций. Спектр инфекционных агентов в наборе «АмплиСенс® ОКИ-скрин-FL» соответствует минимальному спектру исследований клинического материала от пострадавших при вспышках ОКИ (согласно п.6.2 МУК 4.2.2746-10 «Порядок применения молекулярно-генетических методов при обследовании очагов острых кишечных инфекций с групповой заболеваемостью»). Применение данного набора повышает долю этиологически расшифрованных случаев ОКИ c 35% до 70-80% у детей и 50-60% у взрослых.

Нормативные документы 

МУК 4.2.2746-10 «Порядок применения молекулярно-генетических методов при обследовании очагов острых кишечных инфекций с групповой заболеваемостью» Скачать

МУК 4.2.2959-11 «Методы санитарно-микробиологического и санитарно-паразитологического анализа прибрежных вод морей в местах водопользования населения» Скачать 

МУК 4.2.2029-05 Санитарно-вирусологический контроль водных объектов (2006) Скачать

Методическите указания МУК 4.2.2746-10 Порядок применения молекулярно-генетических методов при обследовании очагов острых кишечных инфекций с групповой заболеваемостью Читать

Дополнительную нормативно-методическую информацию вы можете найти на сайте Российского Референс-центра по мониторингу возбудителей кишечных инфекций (РЦКИ) 

Публикации

Информационный бюллетень «Эпидемиология, профилактика и лаб диагностика энтеровирусных инфекций» (2007) Скачать

Hospital-Based Surveillance of Rotavirus and Other Viral Agents of Diarrhea in Children and Adults in Russia, 2005–2007 (2009) Скачать 

Энтеровирус 71 - ящуроподобное заболевание, энцефаломиелит, острый отек легких (2011) Скачать