ИНФОРМАЦИОННЫЙ ЛИСТ
Дата изменения: 25.06.19 версия № 13
Дополнительные требования к выставлению диапазонов калибровки
каналов (приоритеты калибровки) для наборов реагентов АмплиСенс
на амплификаторах Rotor-Gene 3000/6000 (Corbett Research, Австралия)
и Rotor-Gene Q (QIAGEN, Германия)
Приоритеты калибровки для наборов реагентов «АмплиСенс» представлены ниже в таблицах 1, 2, 3. Всего может быть от 1 до 3 уровней приоритетов для каждой программы амплификации и для каждого флуоресцентного канала детекции: 1 уровень – наивысший приоритет калибровки, 3 уровень – наименьший приоритет калибровки.
Как пользоваться таблицей:
1) Найти в таблице названия наборов реагентов, для которых планируется совместная постановка в одном роторе.
2) Для каждого канала детекции выявить набор/наборы реагентов с максимальным приоритетом калибровки.
3) Задать в программе Rotor-Gene в окне «Установки Авто-оптимизации уровня сигнала» номера пробирок, содержащих реакционные смеси с максимальным приоритетом калибровки для каждого используемого канала (см. рис. 1).
4) В случае если приоритеты калибровки для наборов, планируемых для совместной постановки, совпадают по уровню для используемого канала детекции, в окне «Установки Авто-оптимизации уровня сигнала» указывается номер пробирки с реакционной смесью любого из совпавших по уровню наборов.
Рисунок 1
Таблица 1
Приоритеты калибровки для наборов реагентов при использовании программ амплификации «АмплиСенс-1», «АмплиСенс-2», «АмплиСенс-3»
|
Название набора реагентов |
Название ПЦР-смеси-1 |
Очередность калибровки | ||||
|
FAM/ Green |
JOE/ Yellow |
ROX/ Orange |
Cy5/ Red |
Cy5.5/ Crimson | ||
|
АмплиСенс ® C.trachomatis / Ureaplasma / M.genitalium-МУЛЬТИПРАЙМ-FL |
ПЦР-смесь-1-FL C.trachomatis / Ureaplasma / M.genitalium |
2 |
1 |
2 |
1 | |
|
АмплиСенс® C.albicans / C.glabrata / C.krusei-МУЛЬТИПРАЙМ-FL |
ПЦР-смесь-1-FL C.albicans / C.glabrata / C.krusei |
2 |
1 |
2 |
2 | |
|
АмплиСенс ® C.trachomatis / Ureaplasma / M.hominis-МУЛЬТИПРАЙМ-FL |
ПЦР-смесь-1-FL C.trachomatis / Ureaplasma / M.hominis |
2 |
1 |
2 |
1 | |
|
АмплиСенс ®Chlamydia trachomatis-A,B,C-FL |
ПЦР-смесь-1-FL C. trachomatis A, B, C |
2 |
2 |
2 | ||
|
АмплиСенс ® Candida albicans-FL |
ПЦР-смесь-1-FL Candida albicans |
2 |
2 | |||
|
АмплиСенс ® Chlamydia trachomatis-скрин-титр-FL |
ПЦР-смесь-1-FL Chlamydia trachomatis-скрин-титр |
2 |
2 | |||
|
АмплиСенс ® Chlamydia trachomatis-FL |
ПЦР-смесь-1-FL Chlamydia trachomatis |
2 |
2 | |||
|
АмплиСенс ® CMV-FL |
ПЦР-смесь-1-FL CMV |
2 |
2 | |||
|
АмплиСенс ® CMV-скрин/монитор-FL |
ПЦР-смесь-1- FL CMV скрин/монитор |
3 |
1 |
2 | ||
|
АмплиСенс® N.gonorrhoeae / C.trachomatis / M.genitalium / T.vaginalis-мультипрайм-FL |
ПЦР-смесь-1-FL N.gonorrhoeae / C.trachomatis / M.genitalium / T.vaginalis |
3 |
2 |
2 |
1 |
1 |
|
АмплиСенс® Cryptococcus neoformans-FL |
ПЦР-смесь-1-FRT Cryptococcus |
3 |
2 | |||
|
АмплиСенс® C.trachomatis / Ureaplasma / M.genitalium / M.hominis-МУЛЬТИПРАЙМ-FL |
ПЦР-смесь-1-FL C.trachomatis / Ureaplasma / M.genitalium / M.hominis |
3 |
1 |
2 |
1 |
1 |
|
АмплиСенс ® EBV-скрин/монитор-FL |
ПЦР-смесь-1-FL EBV скрин/монитор |
3 |
1 |
2 | ||
|
АмплиСенс ® EBV / CMV / HHV6-скрин-FL |
ПЦР-смесь-1-FRT EBV / CMV / HHV6 / Glob |
3 |
1 |
1 |
2 | |
|
АмплиСенс ® Gardnerella vaginalis-FL |
ПЦР-смесь-1-FL Gardnerella vaginalis |
2 |
2 | |||
|
АмплиСенс® Gardnerella vaginalis / Lactobacillus spp.-титр-FL |
ПЦР-смесь-1-FRT Gardnerella vaginalis/ Lactobacillus spp. |
3 |
1 | |||
|
АмплиСенс® HAV-FL |
ОТ-ПЦР-смесь-1-FEP/FRT HAV |
3 |
2 | |||
|
АмплиСенс® HBV-FL |
ПЦР-смесь-1-FL HBV |
3 |
2 | |||
|
АмплиСенс® HBV-Монитор-FL | ||||||
|
АмплиСенс® HBV-генотип-FL |
ПЦР-смесь-1-FRT HBV генотипы C/D/B/A |
3 |
1 |
1 |
1 | |
|
АмплиСенс ® HBV / HDV-FL |
ОТ-ПЦР-смесь-1-FL HBV / HDV |
3 |
1 |
2 | ||
|
АмплиСенс ® HCV-1/2/3-FL |
ОТ-ПЦР-смесь-1-FEP/FRT HСV-1/2/3 |
3 |
1 |
2 |
2 | |
|
АмплиСенс® HCV-генотип-FL |
ПЦР-смесь-1-FRT-HCV-генотип-1b/3a |
3 |
1 | |||
|
ПЦР-смесь-1-FRT-HCV-генотип-1а/2 |
3 |
1 | ||||
|
ПЦР-смесь-1-FRT-HCV-генотип-5a/6 |
3 |
2 | ||||
|
ПЦР-смесь-1-FRT-HCV-генотип-4/BKO |
3 |
1 | ||||
|
АмплиСенс® HCV-Монитор-FL |
ОТ-ПЦР-смесь-1-FL HCV |
3 |
1 | |||
|
АмплиСенс® HCV-FL | ||||||
|
АмплиСенс ® HDV-Монитор-FL |
ОТ-ПЦР-смесь-1-FL HDV |
3 |
2 | |||
|
АмплиСенс ® HDV-FL | ||||||
|
АмплиСенс ® HGV-FL |
ОТ-ПЦР-смесь-1-FL HGV |
3 |
1 | |||
|
АмплиСенс ® HHV6-скрин-титр-FL |
ПЦР-смесь-1- FRT HHV6 / Glob |
3 |
2 | |||
|
АмплиСенс ® HSV I, II-FL |
ПЦР-смесь-1-FL HSV I, II |
2 |
2 | |||
|
АмплиСенс ® HSV / CMV-МУЛЬТИПРАЙМ-FL |
ПЦР-смесь-1-FL HSV / CMV |
2 |
2 |
2 | ||
|
АмплиСенс ® HSV-typing-FL |
ПЦР-смесь-1-FL HSV-typing |
2 |
2 |
2 | ||
|
АмплиСенсÒ Listeria monocytogenes- скрин-титр-FL |
ПЦР-смесь-1 -FL Listeria monocytogenes |
3 |
2 |
2 | ||
|
АмплиСенсÒ Mycoplasma genitalium-FL |
ПЦР-смесь-1-FL Mycoplasma genitalium |
2 |
2 | |||
|
АмплиСенс ® M.genitalium-скрин-титр-FL |
ПЦР-смесь-1-FL M.genitalium-скрин-титр |
2 |
2 | |||
|
АмплиСенсÒ Mycoplasma hominis-FL |
ПЦР-смесь-1-FL Mycoplasma hominis |
3 |
2 | |||
|
АмплиСенс® M.hominis-скрин-титр-FL |
ПЦР-смесь-1-FL M.hominis-скрин-титр |
3 |
2 | |||
|
АмплиСенсÒ N.gonorrhoeae / C.trachomatis / M.genitalium-МУЛЬТИПРАЙМ-FL |
ПЦР-смесь-1-FL N.gonorrhoeae / C.trachomatis / M.genitalium |
3 |
2 |
2 |
1 | |
|
АмплиСенс® Neisseria gonorrhoeae-скрин-FL |
ПЦР-смесь-1-FL Neisseria gonorrhoeae-скрин |
1 |
2 | |||
|
АмплиСенс ® Neisseria gonorrhoeae-тест-FL |
ПЦР-смесь-1-FL Neisseria gonorrhoeae-тест |
2 |
2 | |||
|
АмплиСенс ® Parvovirus B19-FL |
ПЦР-смесь-1- FRT Parvovirus B19 |
2 |
1 | |||
|
АмплиСенс ® Pneumocystis jirovecii (carinii)-FL (новый формат кат. № R-F2-Mod(RG,iQ,Mx)) |
ПЦР-смесь-1-FRT P.jirovecii / Glob |
3 |
1 | |||
|
АмплиСенс ® Pseudomonas aeruginosa-скрин-титр-FL |
ПЦР-смесь-1-FRT P.aeruginosa |
3 |
2 | |||
|
АмплиСенс ® Rubella virus-FL |
OT-ПЦР-смесь-1- FRT Rubella virus |
3 |
1 | |||
|
АмплиСенс ® Streptococcus pyogenes-скрин-титр-FL |
ПЦР-смесь-1-FL Streptococcus pyogenes-скрин-титр |
3 |
1 |
2 | ||
|
АмплиСенс ® Streptococcus agalactiae-скрин-титр-FL |
ПЦР-смесь-1-FL Streptococcus agalactiae |
3 |
1 |
2 | ||
|
АмплиСенс ® T.vaginalis / N.gonorrhoeae-МУЛЬТИПРАЙМ-FL |
ПЦР-смесь-1-FL T.vaginalis / N.gonorrhoeae |
2 |
2 |
2 | ||
|
АмплиСенс ® Toxoplasma gondii-FL |
ПЦР-смесь-1- FRT Toxoplasma gondii |
2 |
2 | |||
|
АмплиСенс ® Treponema pallidum-FL |
ПЦР-смесь-1-FL Treponema pallidum |
2 |
2 | |||
|
АмплиСенс ® Trichomonas vaginalis-FL |
ПЦР-смесь-1-FL Trichomonas vaginalis |
2 |
2 | |||
|
АмплиСенс® T.vaginalis / N.gonorrhoeae / C.trachomatis-МУЛЬТИПРАЙМ-FL |
ПЦР-смесь-1-FL T.vaginalis / N.gonorrhoeae / C.trachomatis |
3 |
2 |
2 |
1 | |
|
АмплиСенс ® ФлороЦеноз / Микоплазмы-FL |
ПЦР-смесь-1-FL U.parvum / U.urealyticum / M.hominis |
2 |
1 |
2 |
2 | |
|
АмплиСенс ® U.parvum / U.urealyticum / M.hominis-скрин-титр-FL | ||||||
|
АмплиСенс ® U.parvum / U.urealyticum-FL |
ПЦР-смесь-1-FL U.parvum / U.urealyticum |
1 |
1 |
2 | ||
|
АмплиСенс® U.parvum / U.urealyticum-скрин-титр-FL |
ПЦР-смесь-1-FL U.parvum / U.urealyticum-скрин-титр |
2 |
1 |
2 | ||
|
АмплиСенс ® Ureaplasma spp.-скрин-титр-FL |
ПЦР-смесь-1-FL Ureaplasma spp.-скрин -титр |
2 |
2 | |||
|
АмплиСенс ® Ureaplasma spp.-FL |
ПЦР-смесь-1-FL Ureaplasma spp. |
2 |
2 | |||
|
АмплиСенс® VZV-FL |
ПЦР-смесь-1- FL VZV |
3 |
2 | |||
|
АмплиСенс® ВПЧ 16/18-FL (старый формат кат. номер R-V12(RG,iQ,Mx)) |
ПЦР-смесь-1-FEP/FRT ВПЧ 16/18 |
3 |
2 |
2 | ||
|
АмплиСенс® ВПЧ 16/18-FL (новый формат кат. № R-V12-F, R-V12-100) |
ПЦР-смесь-1-FL ВПЧ 16/18 |
3 |
2 |
2 | ||
|
АмплиСенс® ВПЧ ВКР генотип-FL |
ПЦР-смесь-1-FRT ВПЧ 16/18/31 |
3 |
2 |
2 |
2 | |
|
ПЦР-смесь-1-FRT ВПЧ 33/35/56 |
3 |
2 |
2 |
2 | ||
|
ПЦР-смесь-1-FRT ВПЧ 39/45/59 |
3 |
2 |
2 |
2 | ||
|
ПЦР-смесь-1-FRT ВПЧ 51/52/58 |
3 |
2 |
2 |
2 | ||
|
АмплиСенс ® ВПЧ 6/11-FL (новый формат кат. № R-V11-Mod(RG,iQ,Mx), R-V11-100) |
ПЦР-смесь-1-FL ВПЧ 6/11 |
3 |
2 |
2 | ||
|
АмплиСенс® ВПЧ ВКР скрин-титр-FL |
ПЦР-смесь-1-FRT ВПЧ А7+ |
3 |
1 | |||
|
ПЦР-смесь-1-FRT ВПЧ А9 |
3 |
1 | ||||
|
ПЦР-смесь-1-FRT ВПЧ скрин-титр |
3 |
1 |
2 |
1 | ||
|
АмплиСенс® ВПЧ ВКР скрин-титр-14-FL |
ПЦР-смесь-FL ВПЧ 14 |
2 |
1 |
1 |
1 |
1 |
|
АмплиСенс ® Флороценоз / Бактериальный вагиноз-FL |
ПЦР-смесь-1-FRT Флороценоз / Бактериальный вагиноз |
3 |
2 |
2 |
2 | |
|
АмплиСенс ® ФлороЦеноз / Кандиды-FL |
ПЦР-смесь-1-FL ФлороЦеноз / Кандиды |
3 |
1 |
2 |
1 |
1 |
Таблица 2
Приоритеты калибровки для наборов реагентов серии «ОКИ»
|
Название набора реагентов |
Название ПЦР-смеси-1 |
Очередность калибровки | ||||
|
FAM/ Green |
JOE/ Yellow |
ROX/ Orange |
Cy5/ Red |
Cy5.5/ Crimson | ||
|
АмплиСенс ® EHEC-FL |
ПЦР смесь-1-FL EHEC / STI |
3 |
2 | |||
|
АмплиСенс ® Salmonella typhi-FL |
ПЦР-смесь-1-FEP/FRT S.typhi / STI |
3 |
1 |
1 | ||
|
АмплиСенс® Cronobacter sakazakii-FL |
ПЦР смесь-1-FL Cronobacter sakazakii / STI |
3 |
2 | |||
|
АмплиСенс® Helicobacter pylori-FL |
ПЦР смесь-1-FL Helicobacter pylori / STI, ПЦР-смесь-FL Helicobacter pylori |
3 |
2 | |||
|
АмплиСенс® Salmonella spp.-FL |
ПЦР-смесь-FL Salmonella spp. |
3 |
2 | |||
|
АмплиСенс® ОКИ скрин-FL |
ПЦР-смесь-1- FEP/FRT Shigella spp. / Salmonella spp. |
1 |
2 | |||
|
ПЦР-смесь-1-FEP/FRT Campylobacter spp. / Adenovirus |
3 |
2 | ||||
|
ОТ-ПЦР-смесь-1-FEP/FRT Rotavirus / Astrovirus |
2 |
1 | ||||
|
ОТ-ПЦР-смесь-1-FEP/FRT Norovirus / STI |
3 |
2 | ||||
|
АмплиСенс® Эшерихиозы-FL |
ПЦР-смесь-1-FEP/FRT EIEC / EHEC / STI |
3 |
2 |
1 | ||
|
ПЦР-смесь-1-FEP/FRT EPEC / ETEC / EAgEC |
3 |
2 |
1 | |||
|
АмплиСенс® Shigella spp. и EIEC-FL |
ПЦР-смесь-1-FL Shigella spp. / STI |
3 |
2 | |||
|
АмплиСенс® Campylobacter spp.-FL |
ПЦР-смесь-1-FEP/FRT Campylobacter spp. |
3 |
2 | |||
|
АмплиСенс ® Norovirus GI, GII-FL |
ПЦР-смесь-FL Norovirus GI / Norovirus GII |
3 |
1 |
1 | ||
|
АмплиСенс ® ОКИ виро-скрин-FL |
ПЦР-смесь-FL ОКИ виро-скрин |
2 |
1 |
1 |
1 |
1 |
|
АмплиСенс ® ОКИ бакто-скрин-FL |
ПЦР-смесь-FL ОКИ бакто-скрин |
1 |
1 |
2 |
2 |
1 |
|
АмплиСенс® Giardia lamblia-FL |
ПЦР-смесь-FL Giardia lamblia |
3 |
2 | |||
Таблица 3
Приоритеты калибровки для наборов реагентов серии «ОРВИ»
|
Название набора реагентов |
Название ПЦР-смеси-1 |
Очередность калибровки | ||||
|
FAM/ Green |
JOE/ Yellow |
ROX/ Orange |
Cy5/ Red |
Cy5.5/ Crimson | ||
|
АмплиСенс® hRSV-FL |
ПЦР-смесь-1-FEP/FRT hRSV |
2 |
3 | |||
|
АмплиСенс® ОРВИ-скрин-FL |
ПЦР-смесь-1-FL hAdv – hBov |
2 |
2 |
2 | ||
|
ПЦР-смесь-1-FL hCov |
2 |
1 |
1 | |||
|
ПЦР-смесь-1-FL hPiv 1/3 |
2 |
1 |
2 | |||
|
ПЦР-смесь-1-FL hPiv 2/4 |
2 |
3 |
2 | |||
|
ПЦР-смесь-1-FL hRSv – hMpv |
2 |
3 |
1 | |||
|
ПЦР-смесь-1-FL hRv |
2 |
2 | ||||
|
АмплиСенс® Influenza virus A/B-FL (новый формат кат. № R-V36-Mod, R-V36-F) |
ПЦР-смесь-1-FL Influenza virus A/В |
2 |
2 |
2 | ||
|
АмплиСенс® Influenza virus A H5N1-FL |
ПЦР-смесь-1-FEP/FRT Influenza virus A |
1 |
3 | |||
|
ПЦР-смесь-1-FEP/FRT Influenza virus A H5N1 |
2 |
2 | ||||
|
АмплиСенс® Influenza virus A/H1-swine-FL |
ПЦР-смесь-1-FEP/FRT Influenza virus A/H1-swine |
2 |
2 | |||
|
АмплиСенс® Influenza virus A-тип-FL |
ПЦР-смесь-1-FEP/FRT Influenza virus A H1N1 |
2 |
2 |
2 | ||
|
ПЦР-смесь-1-FEP/FRT Influenza virus A H3N2 |
2 |
1 |
1 | |||
Пример
В случае одновременной постановки наборов реагентов «АмплиСенс® ВПЧ 16/18-FL», «АмплиСенс® U.parvum / U.urealyticum-FL» и «АмплиСенс® Gardnerella vaginalis / Lactobacillus spp.-титр-FL»:
|
Название ПЦР-смеси-1 |
Очередность калибровки | ||||
|
FAM/ Green |
JOE/ Yellow |
ROX/ Orange |
Cy5/ Red |
Cy5.5/ Crimson | |
|
ПЦР-смесь-1-FL U.parvum / U.urealyticum |
1 |
1 |
2 | ||
|
ПЦР-смесь-1-FEP/FRT ВПЧ 16/18 |
3 |
2 |
2 | ||
|
ПЦР-смесь-1-FRT Gardnerella vaginalis / Lactobacillus spp. |
3 |
1 | |||
калибровку по каналу FAM/Green необходимо проводить строго по реакционным смесям набора реагентов «АмплиСенс® U.parvum / U.urealyticum-FL»;
калибровку по каналу JOE/Yellow можно проводить либо по реакционным смесям набора реагентов «АмплиСенс® U.parvum / U.urealyticum-FL», либо по реакционным смесям набора реагентов «АмплиСенс® Gardnerella vaginalis / Lactobacillus spp.-титр-FL»;
калибровку по каналу ROX/Orange можно проводить либо по реакционным смесям набора «АмплиСенс® U.parvum / U.urealyticum-FL», либо по реакционным смесям набора реагентов «АмплиСенс® ВПЧ 16/18-FL».
